连锁经营的一个优势是可以获得规模利益，这一般是在利润率比较低的领域作为一种常用发展模式，比如零售往往就与连锁是一体的存在，零售本身就是一个微利的市场，然而借助于零售品类的繁杂也就可以通过连锁获得丰厚的利益，但是这种经营模式并不能在每一个零售领域表现出佳绩，普通商品零售还是可行的，而一旦切换到药品零售也就问题不断了，药品零售实行连锁经营的阻碍在于药品利润更低，本来就较低的利润再加上政策制定的药价控制政策就给了药店极大的压力，一般药店通过纯粹的药品经营能够活下来就不错了，而想规模扩张是极难的。

连锁经营再一个则是规模经营成本的问题，连锁药店经营困难就有这方面因素，各地分店面的管理成本随着店面数量的增加更是与日俱增，如果管理不合理的话那亏损经营是常见的事情，当前我国很多连锁药店在扩张到一定程度以后就停滞不前就是此类原因致使。再行扩张的话就会失去利润，面对这一情形药店多数都只能无奈的陷在困境之中。

这么说的话单体药店岂不是有着较大的发展空间了，其实不然，从长远角度来说连锁规模化都是大势所趋，单体药店的成本不高但是抗风险能力是极差的，特别是中等规模的药店更是生存极难，不大不小的船既难掉头又难以获得规模利益。

对此现在能够拿出的应对方案也是借鉴商超领域的经营理念，信息化管理能够极大的节省经营成本，其中大量的人力和时间成本都能得到控制，而从效率上来说信息化管理也是具有极好的优势的。唯一的缺点就是初期投入的成本较高而且要有一定的意识才行，这方面传统的理念可是不好生存的。