据统计，2011年，哈密市参合农牧民人数达到116,836人，参合率为99.83%，人均筹资为每年310元，属全疆最高标准。哈密市的新农合支付方式改革就是通过新农合基金，依据参合农牧民在乡镇级定点医疗机构实际住院天数，按照“中心卫生院每床每日130元、一般卫生院每床每日110元”的标准对患者给予定额补偿。参合农牧民在乡镇卫生院住院时，免收住院押金，住院期间接受的任何检查、化验、治疗、用药等均不收取任何费用，出院时凭新农合“一卡通”办理出院手续即可。新农合管理中心再将医疗费用按照参合农牧民住院天数以定额补偿的方式补给乡镇卫生院。乡镇级定点医疗机构严格控制住院天数，优化医疗方案，保证治疗质量。

   通过新农合支付方式改革的实施，基层医疗机构的医疗费用得到有效控制。乡镇卫生院初步实现免费医疗，患有常见病、慢性病的农牧民必然将会首选乡镇卫生院，从而减少市级以上医疗机构就诊人数。以前，乡镇卫生院的收入主要靠卖药，现在正好反过来，如果医生多开药，不仅不能增加收入，还会使医院的收益减少，医生不得不自觉尽量少开药，尽量使用疗效快、价格便宜的基本药物。参加合作医疗的农牧民实际受益大幅度提高，改善了“小病拖，大病扛，挂号难，看病贵”的就医现象。