根据深圳医改配套政策的规定，在实施取消药品加成后，深圳会通过分级提高诊疗服务收费标准的方式对医院进行补偿，以此来平衡不同等级医院的收入差距。也就是，门诊诊金在原来的基础上平均每门诊人次提高12元，其中三级医院提高14元，一级、二级医院提高11元；平均每住院床日提高住院诊查费37元，其中三级医院提高43元，二级医院提高33元，一级医院提高24元；参保人员增加的诊疗费用由医保支付，并不增加患者的费用。

   但深圳医改的问题在于，提高诊疗服务收费标准虽然早已有的方案，但因为调价权在广东省物价局，该政策并没有和取消药品加成同步实行，且调整还需时日。

   而与被取消药品加成而满怀失落的其他公立医院相比，香港大学深圳医院则刚刚破茧而出，充满希望，这家由深圳市政府投资35亿元兴建、香港大学负责管理的公立性医院，于7月1日开始试业。港大深圳医院作为深圳医改的样板医院，其在运作方面，深圳市政府目前对其营运提供财政补贴，实行管办分开、政事分开、医药分开、营利与非营利分开的原则；目前港大深圳医院90%的营运资金均为深圳市政府的投入。在港大深圳医院实现盈利之前，深圳市政府对港大深圳医院的持续投入将成为其运营的关键，很显然，深圳市政府与港大的合作是一个非常大胆的尝试，因此，深圳医改唯有建立长远的政府补偿机制和公共卫生投入制度才是的治本之策。