医疗机构到底是为了盈利还是为了提供医疗服务表面来看是一个属性的辨别深层次则关系到医疗机构在医药行业中的定位以及其具体的经营操作模式。比如之前医疗机构坚持非营利性机构时其根本出发点就是为了给患者提供基本的医疗服务，因此那时候医疗机构在整个医药行业中是属于绝对核心地位的，所谓的药企和药商都是定位于为医疗机构提供所需药物的机构而已，至于零售药店这一纯粹的赚取药品利润的机构则是被直接取消。那时候患者在医院就能享受到全方位的医疗服务。但是这种模式我们也看到了其并不符合产业的正常发展规律，因为药企药商的地位偏低难以保证其经营的积极性，而医院管理的项目过多也会造成机构的臃肿和成本的上升，所以随后的医疗机构市场化改革也就顺理成章了。

    在医疗机构的市场化改革中我们看到的最为直接的表现就是医院的药品价格上升了，这一表现的原因很长时间内都被归为医院的责任心缺失所致使，因为药品招标制度的存在其实只是适当的提升了药企和药商的市场地位而已，这时候整个医药行业就连医院都没有绝对的市场主动权。但是药品的零售价在医院却上涨了，经过多年的研究改革有些人才发现其实医院是在迫不得已的情形下才利用药品赚取利润的。因为在市场化改革以前国家支持是医院生存的关键，而在市场化改革以后却减少了这方面的投入，也就是说在减少投入的同时也不给自主经营的空间。医院在面临这种情形下只能依靠自身经营的药品来弥补发展资金的缺口，长此以往自然而然的形成了以药养医的恶性机制。

    目前的医药分开和医院回归公益性本质并不是要其回到改革之前的状态，因为此时医药行业已经形成了从上游到下游的全产业链模式，医院在其中只是一个环节而已，因此未来的医院经营的模式依然是市场化经营而经营理念则更多地体现公益化特性。这样的改革才能使医院在市场经济环境下发挥好服务患者的职能。