连锁经营的连锁方追求的是规模效益，而被连锁方追求的是无本效益;连锁方领先被连锁方的网络、场地、门面、人力等以延伸市场，被连锁方依靠连锁方输送商品、管理方式、经营理念等抗击风波。双方原本是相互合作、相互依靠、互惠互利、缺一不可的，但在实际发展过程中，连锁方往往将自己看作主体，主宰着被连锁方，总认为被连锁方赢得的利润是自己"施舍"的。药店管理规范，有GSP标准。但对于连锁经营管理，管理部门政策上如何控制其开办，如何规范连锁药店的行为等方面，各地有关药监局管理部门都还没有太多的经验和充足的人力开展这一工作，各地对于社会连锁药店和是否六统一的要求开展经营管理工作等还未形成科学、规范的管理体系，因为连锁药店毕竟是新生事物，建立起规范的管理制度还要假以时日。

医药零售连锁行业本身发展时间不长，管理理念、管理技术相对于其他行业处于落后地步，而人力资源管理在国内的出现和发展，相对于其他方面的管理而言又大大落后，因此，在医药零售行业发展过程中表现出来的是重运营轻管理，很多企业高层、店长对于商品品类、营销策略方面耳熟能详，而对于员工激励、沟通、指导等管理尤其是人力资源管理方面的理念和技能都颇感陌生，以至于在日常员工管理过程中，方式简单、行为粗暴，导致员工关系紧张，团队氛围不好，员工的归属感低，大部分员工对企业利益漠不关心，忠诚度较低。

出现这样的问题，既有行业发展的历史原因，也与企业管理者自身认识有关系。这种背景的影响下，人力资源被忽视成为必然，加之大部分医药零售企业的人力资源从业者非专业出生，很难真正影响企业其他管理人员，因此，大部分管理者对于现代人力资源的理念和技术的掌握和运用不多。实际上，人力资源管理理念和技术并不深奥，理论和方法是基于对人性的尊重为前提的，认为人是存在的各种需求和缺点与长处，需要开发、激励，充分的发挥人的潜能，使之为企业，为社会创造效益。管理者结合自身的生活经历，再经过适当的训练，一些基本理念和技巧便可掌握。