在医药分开政策得到大力的执行后医院从销售药品中获得的收益便被相应取消，而通常这部分收益要占据医院整体收益的一大部分，所以在政策的执行过程中保证医院的正常收益以维持运转正是保障政策执行效果的关键，如果医院的利益无法保障那具体的政策在执行时必然会大打折扣。对此有关医改负责人表示未来医改后医院的收益将主要依赖与医保保障以及医疗服务项目的收费。

    从现在的情况来看能保证我国医院收益的只有依靠医保，而我国的医保与国外不同的是资金来源主要源于政府资金，个人在其中的负担并不是很重。也就是用医保资金补助维持医院运转。除了医保之外财政方面对基层各项目的补贴也是其中的一部分。在政府的支持之外医院另一个收益将是新增加的医疗服务收费项目，在部分地区已经开始试点工作，这不仅可以提供一部分收益还能调动医务人员工作的积极性。

    专家分析指出我国的医疗卫生投入数额是非常巨大的，而这部分里只有一小部分才是用于药品的投入，所以医药分开后取消药品加成并不是解决问题的关键。提供一套完善的医疗服务机制才是长久之计。否则各种违规收费问题还是会层出不穷。而医保体系的完善正是在取消医院之前赖以为生的药品加成后提供的收益保障。只有尽可能的不损害各方利益才能保证政策的合理有效执行。