经新疆维吾尔自治区兵团批准，《兵团食品药品监督管理局主要职责内设机构和人员编制规定》于2013年12月27日印发。

　　根据《规定》，新组建的兵团食品药品监督管理局和原机构相比，增加流通环节食品安全监管等2项职责，整合质监部门生产环节食品安全监管、卫生部门食品安全综合协调等3项职责，加强构建防范区域性、系统性食品药品安全风险机制等4项职责；内设机构增加33%，增加后的4个职能处室分别为办公室（规财处、人事教育处、监察处）、应急管理处（投诉举报中心、稽查处）、食品安全监管处、药品化妆品监管处（医疗器械监管处）；人员编制增加50%，局机关行政编制数增至18名；同时，该局加挂兵团食品安全委员会办公室牌子，明确了与兵团农业、卫生、质监等部门的职责分工。